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《燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源檢測方法》征求意見稿發(fā)布

2021-01-13 09:37:29 來源：化工儀器網(wǎng) 閱讀量：6300

　　燕麥嗜酸菌西瓜亞種是近年由國外傳入的毀滅性病害，除為害西瓜外，還會為害黃瓜和西葫蘆，病菌附著在種子或病殘體上越冬，曾導(dǎo)致了嚴重的經(jīng)濟損失，80%的西瓜不能上市銷售。該病菌在世界范圍內(nèi)廣泛分布，寄主眾多，對該病原菌來源地、宿主等信息進行溯源，明確宿主、來源地與物種生物信息之間的規(guī)律性，有利于掌握病菌致病規(guī)律，從而能有效制定相應(yīng)的預(yù)警和防控策略。
 
　　根據(jù)“十三五”國家重點研發(fā)計劃專項“國家質(zhì)量基礎(chǔ)的共性技術(shù)研究與應(yīng)用”中《高頻跨境生物多目標(biāo)高精準檢測技術(shù)研究》項目，中華人民共和國深圳出入境檢驗檢疫局、深圳市檢驗檢疫科學(xué)研究院篩選研究適用于燕麥嗜酸菌西瓜亞種寄主、來源地等溯源信息的核酸基因片段，通過生物信息學(xué)、統(tǒng)計學(xué)、群體生態(tài)學(xué)等研究技術(shù)和方法構(gòu)建了溯源信息的系統(tǒng)進化和網(wǎng)絡(luò)進化關(guān)系對物種歸類鑒定，并于近日發(fā)布了《燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源檢測方法》征求意見稿。
 
　　《燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源檢測方法》的內(nèi)容包括有范圍、病菌的基本信息、方法原理、儀器用具、溯源檢測方法、結(jié)果判斷、樣品與原始數(shù)據(jù)集保存以及資料性附錄。標(biāo)準規(guī)定了應(yīng)用生物信息學(xué)分析方法對燕麥嗜酸菌西瓜亞種進行溯源檢測的方法，其原理是通過對物種具有溯源價值和意義的基因片段的擴增，利用已完成的核酸序列與系統(tǒng)進化和網(wǎng)絡(luò)進化圖對物種進行歸類鑒定，檢測過程是應(yīng)用生物信息學(xué)的分析手段篩選有效區(qū)分種內(nèi)差異并且有效歸類的基因片段或分子標(biāo)記獲得這些基因片段或分子標(biāo)記的核酸序列，應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)手段完成核酸序列與來源地、寄主信息的主成分分析，完成不同來源地、寄主個體的群體分子系統(tǒng)凈化關(guān)系和群體結(jié)構(gòu)分析。
 
　　為確保試驗的順利進行，標(biāo)準中還規(guī)定了需要用到保濕培養(yǎng)箱、超凈工作臺、滅菌箱、-80℃低溫冰箱、pcr擴增儀、冷凍離心機、核酸蛋白分析儀、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、高壓滅菌鍋等精密儀器設(shè)備。
 
　　本標(biāo)準的實施，不僅可以快速、準確、簡便的對燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源信息進行檢測，也可以為燕麥嗜酸菌西瓜亞種寄主植物及植物產(chǎn)品的進境和管理提供技術(shù)保障。故而希望相關(guān)單位能在規(guī)定時間內(nèi)仔細研核本標(biāo)準征求意見稿，并提出建設(shè)性意見，為標(biāo)準的進一步完善添磚加瓦。
 

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